Pógyort tizenkét év, gróf Teleki Lászlót (Teleki Pál néhai miniszterelnök rokonát), úgyszintén a KIE volt nemzeti titkárát hét év, Hartyányi Imre kulákká nyilvánított gazdálkodót, volt KIE-tagot pedig öt év börtönbüntetésre ítélte a koncepciós perek hírhedt bírája, dr. Jónás Béla vezette ítélkezőtanács. Pógyor István a súlyos fizikai bántalmazások és az elemi orvosi ellátás hiánya következtében 1953 novemberében az ÁVH börtönében vesztette életét. 1951 őszére, a katolikus egyházat ért újabb támadással egy időben a református összeesküvés forgatókönyve is összeállt, s az ÁVH által készített listán a református egyháznak a hivatalos egyházpolitikát potenciálisan ellenző minden jelentős lelkésze és világi személyisége helyet kapott. A forgatókönyvet azonban egyházpolitikai szempontok miatt nem érvényesítették. Ennek ellenére az 1951-es KIE-per koncepciógyártási mechanizmusa a későbbi református egyházi perek szempontjából így is modellként működött. A protestáns összeesküvés itt kikristályosodott koncepciója és a per szerkezete ugyanis 1956 után több állambiztonsági operatív tervben, illetve protestánsok ellen indított eljárások előkészítésében visszaköszönt.